Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm9887F6RFI0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm9887F6RFI0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm9887F6RFI0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm9887F6RFI0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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