Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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