Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms