Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms