Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ryr1E9PZQ0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms