Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms