Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3bE9PUL3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms