Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cngb1E1AZ71 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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