Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc6D3YZP9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms