Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd1D3YXK1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms