Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d4D3YUH6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms