Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cttnbp2B9EJA2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cttnbp2B9EJA2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms