Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ankrd34aB2RW11 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ankrd34aB2RW11 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms