Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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