Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms