Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms