Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rrn3B2RS91 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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