Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap42B2RQE8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms