Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr29B1ARI9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr29B1ARI9 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms