Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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