Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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