Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Atp8b5A3FIN4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Atp8b5A3FIN4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Atp8b5A3FIN4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Atp8b5A3FIN4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Atp8b5A3FIN4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Atp8b5A3FIN4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms