Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scn3aA2ASI5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms