Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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Rtf1A2AQ19 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Rtf1A2AQ19 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Rtf1A2AQ19 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Rtf1A2AQ19 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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