Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabreA2AMW3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms