Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms