Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ambra1A2AH22 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms