Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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