Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PtprfA2A8L5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PtprfA2A8L5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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PtprfA2A8L5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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