Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Krtap1-3A2A588 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms