Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms