Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pdpk1Q9Z2A0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Pdpk1Q9Z2A0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Pdpk1Q9Z2A0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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