Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx39bQ9Z1N5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms