Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup160Q9Z0W3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup160Q9Z0W3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup160Q9Z0W3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup160Q9Z0W3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup160Q9Z0W3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup160Q9Z0W3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup160Q9Z0W3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup160Q9Z0W3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup160Q9Z0W3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup160Q9Z0W3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms