Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabbr1Q9WV18 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms