Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms