Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod1Q9R0E2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms