Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms