Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms