Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a3Q9QZS0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms