Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt3Q9QZ47 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms