Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phtf1Q9QZ09 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms