Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms