Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pdzd4Q9QY39 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pdzd4Q9QY39 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pdzd4Q9QY39 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pdzd4Q9QY39 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pdzd4Q9QY39 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pdzd4Q9QY39 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pdzd4Q9QY39 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pdzd4Q9QY39 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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