Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms