Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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