Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms