Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabgef1Q9JM13 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rabgef1Q9JM13 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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