Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1aQ9JLR9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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