Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclk1Q9JLM8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclk1Q9JLM8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms